L'endosymbiose archaïque entraîne l'induction du phénotype de Warburg et une augmentation de la glycolyse ainsi qu'un dysfonctionnement mitochondrial. Le pyruvate généré à la suite de la cascade glycolytique entre dans le shunt GABA où il est converti en glutamate, GABA et succinyl CoA. Le pyruvate est converti en glutamate qui est traité par la glutamate déshydrogénase et génère de l'ammoniac. L'archée endosymbiotique peut oxyder l'ammoniac pour son énergie. Le catabolisme du cholestérol des archées, médié par la cholestérol oxydase des archées, peut également produire une oxydation du cycle du cholestérol pour générer du pyruvate. Le pyruvate est converti en glutamate par l'enzyme glutamate pyruvate transaminase sérique. Le glutamate est traité par la glutamate déshydrogénase pour produire de l'ammoniac. L'uréase des archées peut agir sur l'urée en générant de l'ammoniac et du thiocyanate. Les archées sont oxydantes d'ammoniac et peuvent utiliser l'ammoniac pour leur énergie. L'activité uréase des archées liée à la synthèse d'ammoniac et de thiocyanate ainsi que l'activité cholestérol oxydase générant du pyruvate et de l'ammoniac sont importantes pour la schizophrénie, les tumeurs malignes, le syndrome métabolique X, les maladies auto-immunes et la dégénérescence neuronale.
