La proteomica è lo studio del proteoma, il complemento proteico del genoma. Questo campo di ricerca ha acquisito il nome di "Proteomica". Le proteine espresse dal genoma sono state definite "Proteoma", un termine usato per la prima volta in pubblico da Mare Wilkins alla prima conferenza di Siena sulla proteomica nel 1994.13 La saliva è un fluido corporeo molto interessante per la diagnosi delle malattie per molte ragioni, come il fatto che la raccolta della saliva è di solito economica, sicura, facile e può essere eseguita senza l'aiuto di operatori sanitari, consentendo un campionamento a domicilio); inoltre, è considerata un processo accettabile e non invasivo dai pazienti perché non provoca alcun dolore e può essere facilmente raccolta per i pazienti nella fascia di età pediatrica.14Recenti piattaforme proteomiche hanno analizzato il proteoma salivare umano, caratterizzando circa 3000 proteine e peptidi espressi in modo differenziato, molti dei quali di origine microbiologica.15Generalmente lo studio della proteomica si basa su metodologie per la separazione e l'identificazione dei protieni come l'elettroforesi 2-D, l'elettroforesi capillare e la cromatografia liquida ad alte prestazioni (HPLC), in combinazione con la spettrometria di massa.