Unter Proteomik versteht man die Untersuchung des Proteoms, der Proteinausstattung des Genoms, und dieser Forschungsbereich hat den Namen "Proteomik" erhalten. Dieser Begriff wurde erstmals von Mare Wilkins auf der ersten Proteom-Konferenz in Siena im Jahr 1994 öffentlich verwendet.13 Speichel ist aus vielen Gründen eine sehr attraktive Körperflüssigkeit für die Krankheitsdiagnose, da die Speichelentnahme in der Regel kostengünstig, sicher und einfach ist und ohne die Hilfe von medizinischem Personal durchgeführt werden kann (es ist also eine Probenahme zu Hause möglich); außerdem wird sie von den Patienten als akzeptables und nicht-invasives Verfahren angesehen, da sie keine Schmerzen verursacht und bei Patienten im Kindesalter leicht durchgeführt werden kann.14Jüngste Proteomik-Plattformen haben das menschliche Speichelproteom analysiert und dabei etwa 3000 unterschiedlich exprimierte Proteine und Peptide charakterisiert, von denen viele mikrobiologischen Ursprungs sind.15 Im Allgemeinen stützt sich die Proteomik-Studie auf Methoden zur Trennung und Identifizierung von Proteinen wie 2-D-Elektrophorese, Kapillarelektrophorese und Hochleistungsflüssigkeitschromatographie (HPLC) in Kombination mit Massenspektrometrie.
