Ce livre présente un nouveau système de reconstruction automatisée des surfaces corticales à partir d'images de résonance magnétique pondérées en T1. Au c¿ur du système se trouve un cadre d'analyse de Reeb unifié pour la détection et l'élimination des valeurs géométriques et topologiques aberrantes sur les limites des tissus. Grâce à l'analyse de Reeb intrinsèque, le système peut localiser avec précision les branches parasites et les valeurs topologiques aberrantes, et les rectifier par un filtrage localisé en utilisant des informations provenant à la fois des distributions d'intensité de l'image et de la régularité géométrique. Ce système développe une classification améliorée des tissus avec des caractéristiques hessiennes pour une meilleure robustesse à l'inhomogénéité de l'image, et une interpolation adaptative pour atteindre une précision sous-voxel dans les surfaces reconstruites. En intégrant ces nouveaux développements, un nouveau système a été conçu. Le système peut reconstruire automatiquement les surfaces corticales avec une qualité améliorée et un coût de calcul considérablement réduit par rapport au célèbre logiciel Free Surfer. En comparaison avec Free Surfer, le travail présenté montre que le système est capable de générer des surfaces qui représentent mieux l'anatomie corticale et de produire des caractéristiques d'épaisseur avec une plus grande puissance statistique dans les études de population.